左光斗也坚辞官职，朱由检见二人又上来了那股执拗劲，也只得无奈地笑道：“杨先生当年在诏狱写下血书，‘大笑大笑还大笑，刀砍东风，于我何有哉’，那是何等气魄，今日怎么有这么多顾虑呢。也罢，既然二位先生不愿上朝，朕还有两个紧要位子要烦劳二位。京师与南京国子监的原国子监祭酒都是阉党一派，已被朕免职了。二位既然在小山村中可以教小童读书，那出任国子监祭酒，为国传道授业应该也没问题吧。这次可不许推辞，否则朕要生气了！”
杨涟与左光斗其实当然也愿意继续为国效力，见朱由检如此为他们悉心安排，自是感激不已，顿首受职。而且以二人的才学风骨，尤其是左光斗原来就做过会试考官，做国子监祭酒（相当于大明最高学府的校长）自是游刃有余。
朱由检就于车前宣旨，任命左光斗为京师国子监祭酒，杨涟为南京国子监祭酒。由于南京路远，杨涟又刚长途跋涉而来，允其在京休养一个月再赴任。
这“东林六君子”在大臣和百姓中颇有名气，此时见朱由检不但为六人昭雪，还全部重用，自是欢声雷动。其中有三个年轻人喝彩的嗓门最大，朱由检不禁侧目，却惊讶地叫出声来：“怎么是你们？”
原来这三人正是他在一年多前密赴登州之时，在函谷关夜遇的三位青年才俊黄宗羲、顾炎武和王夫之！
朱由检赶忙来到三人跟前微笑着道：“三位，觉得朕面熟么？”
三人本来夹在人群之中，离朱由检较远，也没认出这位年轻的皇帝。此时定睛细看，黄宗羲却失声叫道：“你不就是那个尤…”
顾炎武忙扯了他一把，黄宗羲猛然醒悟，三人赶紧跪倒行礼。朱由检把他们搀起来亲切地道：“你们是来京师参加恩科么？”
当今天子，竟是当年大车店中的小行商，而且还不忘旧情！黄宗羲与王夫之均激动得说不出话来，只有顾炎武还把持得住，沉声禀道：“回陛下，草民等正是要参加恩科。除此之外，听说陛下要在天桥亲审阉党成员，黄兄之父即是被阉党害死在狱中的，他愿出堂作证，为父洗冤！”
朱由检喜道：“很好，那么我们公审时再见，朕也提前祝你们考场得意，鱼跃龙门！”
三人自是千恩万谢，周围的大臣们却是交头接耳，不知道皇帝怎么会认识三个不起眼的学子，还如此重视他们。而朱由检自然知道这三位在历史上的分量，也懒得理会众臣的鄙夷目光。
见完东林六君子，朱由检又望见了恭谨地侍立在蕊儿
…。。