操大败，士卒死伤大半，曹操本人也被流矢所伤。
而后关东军再不敢言出战，接着又是诸军之间发生了相互火并，联盟随即崩溃。
联盟散后，群雄相互攻伐，大汉帝国领土上一时间战火纷飞，百姓流离失所。献帝势力没有参与此战，境内居民安康，大量流民因而涌入。
献帝将流民迁移安置在荆州南部数郡内，既解决了流民问题，又使得荆南地区得到很好的开发。
汉元399年王允勾结吕布计杀董卓。由于王允不肯赦免西凉军，西凉军反。吕布战败逃出长安，王允被西凉军所杀。
吕布逃出后占据宛城地区，南部和荆州接壤。而后双方在边境地区多次发生冲突，初始荆州军常败，连荆州大将孙坚也战死其中一役。
献帝军事上这时已经实行了军农分离，所以每年趁吕布领地农忙时节，便出兵骚扰吕布。加之时有灾年发生，所以不出五年，吕布败亡。
吕布亡后献帝收其残部，组织了自己的第一支骑军部队。这支骑军的主将就是我的祖先张辽张文远。
汉元405年献帝派遣孙策、周瑜率部攻打江东地区，一年后江东平定。随后攻击刚称帝的袁术。这时献帝麾下军力充沛，军资齐整，不出数月袁术灭亡。
汉元407年4月献帝伐汉中张鲁，9月张鲁灭亡。
汉元409年3月献帝兵分两路进发益州，张辽所部从小道入川后，奔袭800里巧取成都，益州不战而降。
同年西凉马氏家族归顺献帝，随后与献帝合兵消灭了韩遂，凉州及三辅地区遂归于献帝。同年末并州南匈奴也同时归附献帝。至此大汉大部地区已经掌握在献帝手中。
汉元414年因汉贼曹操胁天子已令诸侯，献帝起兵清君侧。此时曹操占据司州、豫州、青州、徐州、兗州五州之地，手下三十万精锐青州军，实力强劲。
双方历四年攻伐，最终献帝击败曹操。曹败后在退至青州临淄，献帝围城数月。直到城中粮草耗尽，曹操放火烧城。少帝及残余曹部均烧死于城中。只有曹操族亲夏侯渊，在曹操的授意下在司州归降献帝。
汉元417年始，献帝宣翼州、幽州牧刘备来朝。备自以皇叔身份，屡宣不至。献帝于汉元419年下令讨伐刘备。
献帝大军北上，备部军心溃散，将领纷纷归降。刘备无奈退至北平坚守不出。献帝于汉元419年5月围城到8月攻克北平。备手下大将张飞战死、关羽被擒、备畏罪自杀。
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