福建搜刮财物、粮食、物资供南京所用。
于是清军立刻在福建省境内烧杀抢掠，无恶不做，无所不为，一开始还是在州府县城里面，但很快就发展到镇乡村落之中，只要是稍反抗，动辄就将全村、全乡的人都杀光。不少地方都被清军屠杀殆尽了。
在短短几天的时间里，清军也立刻掠夺到了巨额的财富。虽然洪承畴也知道，这样的掠夺方式无异于饮鸩止渴，但一來这是清军的传统，二來南京的财政确实十分紧张，就连北京都盯着南方，因此也就默然不语。
而就在这时，郑芝龙写信给洪承畴，大台老少牢骚，认为自己将军队都撤出险要，让清军得以顺利进军福建、并擒杀了朱聿键，己经表现出了足够的诚意，而清军现在还对自己步步紧逼，做得实在太过份了。