在第一次进攻苏州失败之后，叛军又向苏州増加了大量兵力，全军总数达到了五万余人，但上一次的失败也让马进忠心有余悸，如果再失败一次，进攻苏州的计划也就将彻底破灭了，因此马进忠虽然扩大的人马，但也不敢轻易向苏州发动进攻。
而就在这时，马进忠也接到了消息，知道商家军趁虚进取杭州，要他立刻领军回援，马进忠也不敢怠慢，而且正好可以借梯下墙，立刻收拾人马，撤离了苏州，向杭州进发。
苏州杭州之间，相隔还不到两百里的路程，大队人马行进，最多也就两三天的时间，但南京离杭州同样也不远，而且商家军又比叛军早了一天的时间出发，而且五万多大军，也不是说走就能走的，拔营起寨，整装出发，还需要不少时间，因此马进忠首先派自己手下的部将卢军，率先五千人马先行，抢先赶回杭州驻防，自己带领着大军随后而行。
直到第二天，马进忠的大军才开始出发，一路向南，走了一天，在傍晚时分，进入湖州地界，大军又安营下寨休息，准备明天再赶回杭州。而就在当天晚上，马进忠收到消息，卢军的前部人马在武康县东北地方遭到了商家军的伏击，以经全军覆没了。
马进忠得知以后，也不由大吃一惊，他就是纵横明末的农民军首领之一，绰号混十万，也征杀了十余年，虽然不敢说是精通用兵之道，但至少也是身经百战了。立刻想到，商家军这会不会是用围城打援之计呢？
其实还真叫马进忠猜对了，商毅用的，就是围城打援。其实早在制定进攻杭州的战术计划时，商毅的目地就不单纯是要收复杭州，而是要借机将叛军的主力人马也一举消灭。
因为如果只是要收复杭州，根本就不需要这么复杂，只用把大军开到杭州城下，用红夷大炮轰开城门就行了。但商毅知道，这样做仅仅只能夺下一座杭州城，如果叛军不被打灭，就会在整个浙江四处流窜，危险城外的村乡镇县，破坏性极大。又重现自己在湖广与张献忠交战的结果，虽然最后把张献忠打得全军覆没了，但整个湖广也被张献忠破坏了大半。商毅一定要避免这样的结局又在浙江出现。
于是商毅一开始用韬晦之计，引诱叛军从杭州倾巢出动，全力进攻苏州，而自己突然从南京出兵，进攻杭州，这一来叛军必然会立刻起回来救援杭州，而自已正好可以施用围城打援，首先消灭回援的叛军，将叛军的主力彻底打残，然后再收复杭州，就可以立刻平定浙江的叛乱了。整个计划其实一环扣一环，不仅周密详细，而且构思巧妙，除了商毅之外，
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