廷臣对此意见很大；此次平叛之战，则是卢象升和孙传庭两名文官指挥，幸好这两人军事才能都还不错。
所以军机处大臣的人选，朱由检其实心中已经有数。兵部尚书王洽、兵部侍郎杨嗣昌是必不可少的，这两人都是阁臣，王洽还是东林党人，也算是给了东林党一个面子。
接下来还要有户部尚书毕自严和工部尚书徐光启。户部自不必说，兵马未动粮草先行，没有户部配合，任何军事行动都无法开展；工部也是一样，朱由检新设立的工厂，大部分归到工部，也基本都是军事用途。而且这两人都是中间派，也不会让军机处成了东林党的天下。
但是还有一个人，东林党绝不会想到，那就是卢象升。朱由检打算在廷推之时，让温体仁和周延儒力推卢象升。卢象升现在是直接掌兵的，只要他能入军机处，那就开了军事直接指挥者进入最高权力机构的先河，为下一步真正的武将进入军机处做了铺垫。
不过卢象升现在肩负驰援南京的重任，暂时还无法回京师。朱由检的思绪不禁飘到了千里之外的长江北岸，在那里，他的将士们能不能粉碎叛军的计划，将流贼一举歼灭呢？