刘备伐吴，孙权向魏称臣，许诺送来儿子作人质，送回俘虏于禁，很久没有到达。曹丕疑惑，询问司马孚，司马孚建议不要紧逼，而是准备部队，静观其变。后来，于禁到达，只是因为路上得病而有所耽搁，而孙权的儿子终究没有送来。曹丕率军到达长江岸边，责问吴国违背诺言，于是吴魏关系恶化，吴国停止进贡。之后，司马孚外放为河内典农，赐爵关内侯，又转任转清河太守。
【226年】
魏明帝曹睿继位，欲启用司马孚，问身边的人：“司马孚有他兄长的风范吗？”身边的人回答说：“和他的兄长很相似。”曹睿说：“我有司马懿兄弟二人，还有什么可担心的？”于是任命司马孚为度支尚书。度支尚书，魏文帝曹丕时开始设置，掌管国家财政。
司马孚认为要擒敌获胜，应该先有准备，每次诸葛亮入侵关中地区，边境的士兵不能抵挡，需要调集中央军队奔赴战场，仓猝间总是来不及准备，应该预先选出步骑二万部队，分为两部，以作交战之用。他又建议，关中地区连年交战，粮食物资储备不足，应该从冀州调集农夫五千人屯于上邽，秋冬训练，春夏屯田。这些建议都被采纳，于是关中物资充实，对待蜀国的进攻也有应对。
【239年】
魏帝曹芳继位，曹爽、司马懿共同辅政。后来曹爽专权，李胜、何晏、邓飏等乱政，司马孚不管杂事，唯端正自己的行为避免被人陷害而已。
【249年】
司马懿发动“高平陵事变”，政变夺权，司马孚同司马师一起屯兵司马门，控制京师。曹爽一党被诛杀，司马孚因功进爵长社县侯，加侍中。后来，司马孚升任司空，又代替王凌为太尉。
【253年】
吴将诸葛恪征发二十万人伐魏，围攻新城。司马孚督诸军二十万防御，到达寿春，派毌丘俭、文钦等进攻。诸将想迅速出击，司马孚说：“进攻的一方，是要消耗大量人力才能成功的，暂且使用诈巧，不要与敌人力争。”故意滞留了一个多月才进军，此时吴军士卒疲劳，加之瘟疫流行，于是望风而退。
【255年】
蜀将姜维进攻陇右，雍州刺史王经战败，朝廷派遣司马孚镇守关中，统领诸军。不久，征西将军陈泰与安西将军邓艾进击姜维，姜维撤退。司马孚回到京师，转任太傅。
【260年】
魏帝曹髦不满司马昭****，率宫人讨伐司马昭，于宫门处被杀。百官不敢奔赴，司马孚前往，枕尸痛哭，说：“让陛下
…。。