这与三公九卿制有根本区别。
皇帝为加强皇权，拼命的扩大三省权利，扩充三省机构，三公九卿制被严重冲击。
三公之中除丞相省置无恒且尚有实权外，九卿已徒有虚名，到了东晋时甚至已经可有可无。
东晋桓温说：“今事归台阁，而九卿为虚设，皆宜省并。”台阁指的就是尚书省的别称。
《后汉书·仲长统传》载《昌言·法诫篇》云：“光武皇帝……政不任下，虽置三公，事归台阁。”唐李贤注：“台阁谓尚书也。”因汉尚书台在宫禁内，乃有此称，掌与公府对举。
哀帝省掉了光禄勋、大司农。元帝省掉了太仆。东晋后，大鸿胪有事则置，无事则省，宗正并到了太常之下，又省掉了少府。
于是乎，东晋后九卿就只剩下了三卿充充门面。三公九卿一制名存实亡。
到了南北朝时期，虽然朝代变更不止，少数民族入侵，但是在中央官制上并没有阻止三公九卿的进一步衰败。
刘宋出了一种
“三公”
“三司”
“两大”的中央官制。三公就指太傅，太师，太保；三司是太尉、司徒、司马；二大指大将军、大司马。
但已经不设九卿。隋朝统一中国后，隋文帝制三省六部，原本的三公也被取缔。
三公九卿制最终宣告寿终正寝。